Озеро расположено в западной части Карелии, в верховьях бассейна р. Лендерки. Площадь водной поверхности 163,9 кв. км, общая площадь (с островами) 177,3 кв. км. Наибольшая длина 27,3 км, наибольшая ширина 13,2 км. Островов 97, их площадь 13,4 кв. км. Береговая линия сильно извилиста; ее длина по материку 160 км, с островами 275 км.
Наибольшая глубина озера 34 м, средняя глубина 8,6 м. Наиболее глубокими частями являются центральное плесо с глубинами до 34 м и северная часть с глубинами до 31 м.
Озеро вытянуто в общем направлении с северо-запада на юго-восток; северная и южная части расширены в широтном направлении. Разделяется на три основных плеса: северное широкое с многочисленными островами, центральное открытое и юго-западное островное; имеется много широко открытых и обособленных заливов. Около 90% протяжения береговой линии занимают каменистые берега (каменисто-обломочные, валунно-галечные, скалистые) и частью каменисто-песчаные; песчаные пляжи встречаются в разных местах озера небольшими участками. Берега большей частью маловозвышенные, покрыты лесом.
Лексозеро является одним из звеньев водной системы, соединяющей ребольские и лендерские озера с водоемами Финляндии. Общий сток через р.Вуоксу в Ладожское озеро. Половина вод, питающих озеро, поступает из Торосозера через короткий проток Вирда. Кроме того, через короткие протоки в водоем поступают воды из Талвислакши (на западе) и Вожъярви (на востоке); на юге впадает р.Пенинга. Остальные притоки- небольшие ручьи и речки. Сток вод через находящийся на юге: проток Шуннаншалми в Каргиозеро.
В Лексозере обитают 14 видов рыб: озерная форель, ряпушка, сиги, хариус, щука, плотва, елец, язь, гольян, лещ, уклея, окунь, ерш, налим. Основное значение при организации промысла могут иметь ряпушка, сиг и окунь, второстепенное – плотва, налим и щука. Ельца, язя, кумжи, леща, ерша и уклеи в Лексозере мало.