Шуньга – одно из самых древних и крупных поселений Заонежья. Первые письменные упоминания о Шуньге встречаются в списке Челмужской обводной грамоты 1375 года. В XV веке Шуньга служит перевалочным пунктом на пути транспортировки соли с Беломорья. В XVI веке Шуньга – центр одного из заонежских погостов, а так же крупное торговое поселение, основным товаром которого были сукна и холсты из льна.
В XVII веке – ярмарочный центр на Русском Севере: Богоявленская (6-18 января), Благовещенская (25 марта - 2 апреля), Никольская (6-12 декабря), Сборная (с 1 воскресенья Великого Поста, 6 дней) - главный на Русском Севере пункт для обмена рыбы и дичи с беломорских промыслов на товары, производимые в Олонецкой губернии и других областях России.Заонежское село Шуньга испокон веку славилось своей ярмаркой. И несколько лет назад власти Медвежьегорского района возродили эту забытую традицию.
В 18 веке в Шуньге действовал железоделательный завод, который специализировался на отливке якорей для военных кораблей. В конце 19 века большую известность получили изделия заонежских вышивальщиц.
Окружающий ландшафт в высшей степени живописен. Застройка села занимает берега озера Путкозеро и скалистый остров, где находился Шунгский погост (церкви погоста утрачены). От места погоста с вершины скалы открывается широкая панорама озера. В Шуньге сохранились отдельные старые постройки.
Близ Шуньги на северо-западном берегу озера Путкозеро, расположен выходящий на поверхность разрез с жилами шунгита. Горная порода, получившая название от села Шуньга, где он был открыт геологом Иностранцевым в конце 19 века, добывалась "Шиферной горы" для изготовления аспидной доски для столов, каминов, подоконников. В настоящее время разрез является государственным региональным памятником природы Карелии.