Часовня Михаила, Петра и Павла имеет традиционную объемно-планировочную структуру, которая состоит из сеней, трапезной, молельного помещения.
Здание в плане прямоугольное. Над сенями надстроена восьмигранная невысокая звонница с шатровым покрытием. Основное помещение часовни завершается двускатной крышей. Вход устроен с северной стороны через сени. Часовня рублена из бревен, а позже, в XIX веке, снаружи обшита тесом. Резьбой оформлены столбы звонницы и причелины кровли.