Образован в 1986 году в целях сохранения типичных и уникальных природных комплексов и объектов, памятников истории и культуры юго-восточной части Республики Карелия, поддержания экологического баланса, а также развития туризма и создания условий для активного отдыха населения. Территория заказника - одно из немногих в Карелии мест с хорошо развитыми дюнами, простирающимися параллельно берегу за полосой пляжей. К северу от устья р. Черной встречаются обнажения твердых кристаллических пород, обработанные ледником, - так называемые «бараньи лбы». Уникальным памятником послеледниковой эпохи является озеро-лагуна Муромское.
Разнообразна растительность заказника. Более 60% площадей занимают суходольные и заболоченные леса: сосняки, ельники, а также березняки и ольшаники. Большой научный и познавательный интерес представляет одно из крупнейших болот Карелии - Муромское, площадью около 10 тыс. га, где представлены различные типы растительных сообществ. В окрестностях Муромского монастыря и по берегам р. Черной сохранилась луговая растительность. На лугах выявлено более 40 видов растений. Своеобразна прибрежная флора. Там, где полоса пляжей, образованных мелким кварце¬вым песком, постепенно переходит в зону дюн, поселяются растения-пионеры, закрепляющие пески: овсяница красная, волоснец песчаный, вейники, щавелек, чина морская, а также охраняемая в Карелии гвоздика песчаная.
Животный мир заказника типичен для тайги и включает почти весь набор видов, обитающих в Прионежье, включая лося, медведя, волка и др. Из птиц обычны тетерев, глухарь, рябчик, встречаются внесенные в Красную книгу РСФСР орлан-белохвост и скопа. Водоемы богаты рыбой, в том числе ценными и промысловыми видами (судак, сиг, ряпушка, озерный лосось, хариус и др.).
В пределах заказника находится уникальный комплекс памятников первобытной культуры Карелии - многочисленные древние захоронения, стоянки, наскальные изображения. На мысу Бесов Нос, о-вах Большой и Малый Гурий можно увидеть более 600 петроглифов, включающих солярные и лунарные знаки, сцены охоты и рыбной ловли, изображения птиц и зверей. К памятникам истории относится и вновь возрожденный Муромский Свято-Успенский мужской монастырь, основанный в XIV веке. Его живописные окрестности с высокими стенами ка¬менных соборов, древними соснами, песчаными дюнами и синими просторами Онеги дают образное представление о духовной жизни средневековья Севера России.